哈尔滨医科大学2021在全国本科院校排名第145位，强于第146名的第二军医大学，第147名的中国美术学院，第148名的温州医科大学，第149名的中国音乐学院，第150名的重庆邮电大学。在黑龙江排第6名，强于第7名的哈尔滨理工大学，第8名的东北石油大学，第9名的哈尔滨师范大学，第10名的黑龙江中医药大学，第11名的哈尔滨商业大学。
| 竞争力排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 145 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 6 |
| 2020 | 130 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 4 |
| 2019 | 133 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 5 |
| 2018 | 140 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 5 |
| 2017 | 100 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 3 |
综合实力排名（校友会版）
在全国本科院校排名第105位，在黑龙江排第3名。
| 校友会排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2020 | 105 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 3 |
| 2019 | 131 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 6 |
| 2018 | 125 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 5 |
| 2017 | 127 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 5 |
综合实力排名（软科版）
在全国本科院校排名第117位，在黑龙江排第3名。
| 软科排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2018 | 117 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 3 |
| 2017 | 117 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 3 |
