吉林医药学院2021在全国本科院校排名第798位，强于第799名的安顺学院，第800名的贵州警察学院。在吉林排第25名。
| 竞争力排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 798 | 吉林医药学院 | 吉林 | 25 |
| 2018 | 786 | 吉林医药学院 | 吉林 | 26 |
| 2017 | 761 | 吉林医药学院 | 吉林 | 26 |
| 2016 | 772 | 吉林医药学院 | 吉林 | 26 |
| 2015 | 719 | 吉林医药学院 | 吉林 | 25 |
综合实力排名（校友会版）
在全国本科院校排名第565位，在吉林排第25名。
| 校友会排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2020 | 565 | 吉林医药学院 | 吉林 | 25 |
| 2018 | 590 | 吉林医药学院 | 吉林 | 19 |
| 2017 | 615 | 吉林医药学院 | 吉林 | 21 |
综合实力排名（软科版）
在全国本科院校排名第403位，在吉林排第14名。
| 软科排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2018 | 403 | 吉林医药学院 | 吉林 | 14 |
| 2017 | 426 | 吉林医药学院 | 吉林 | 13 |
